江苏省南通中等专业学校初创于上世纪六十年代。1995年，经市政府批准，原江苏省南通职业高级中学、南通工业管理干部学院、南通市纺织技校和南通市虹桥一中四校合并重组，成为南通地区一所综合性的主体职业学校。2010年5月，学校更名为“江苏省南通中等专业学校”。2014年5月，学校成为“江苏联合职业技术学院南通分院”。

江苏省南通中等专业学校历经数十载，先后被确定为国家重点中等职业学校、江苏省四星级中等职业学校暨江苏省高水平示范性职业学校。2013年，成为首批国家中等职业教育改革发展示范学校，率先进入全国职业教育先进行列。2014年，学校荣获全国职业教育最高奖——第四届黄炎培职业教育优秀学校奖。2015年，学校被确定为首批江苏省高水平现代化职业学校。2017年，学校成为首批江苏省现代化示范性职业学校。

江苏省南通中等专业学校的改革发展大致历经了四个阶段：一是“九五”期间的调整阶段。学校初步实现了资源整合并形成了办学模式的基本框架；二是“十五”期间的发展阶段。学校推进改革，在内涵建设与新校区整体规划方面取得了新的突破；三是“十一五”期间的提升阶段。投资1.5亿元的实训基地全面建成，学校成为江苏省四星级中等职业学校暨江苏省高水平示范学校；四是“十二五”期间的转型发展阶段。学校创新发展，蓄势提升，在办学层次、体系建构、服务功能以及现代化建设等方面实现了历史性跨跃。

江苏省南通中等专业学校坐落于南通市区北翼新城，占地240亩。拥有120多个高水平、现代化的与专业教学匹配的实训场所和高标准的室内体育馆。学校有一支结构合理、素质优良的师资队伍。专任教师中，“双师型”教师占86％，硕士研究生占38％，高级职称教师占半数以上；有国家名师、教授级高级讲师以及省、市特级教师、劳动模范、领军人物、骨干教师等40余名。学校开设与地方产业结构相吻合的信息工程、机械工程、机电技术、艺术设计、财经商贸等五大类二十多个专门化方向的主干专业和特色专业。目前，学校拥有七个省级品牌专业，一个省级特色专业，两个省级现代化专业群、两个省级现代化实训基地，三个“3+4”、八个“3+3”现代职教体系建设试点项目。学校众多专业和基地先后被确定为省示范专业、省高水平实训基地、省职业教育技能教学研究基地、省职业教育课程改革实验基地、国家级服装人才培养基地、国家紧缺人才培养基地、全国职业院校数字校园建设实验基地、省和国家技能大赛赛点基地、技能鉴定中心、市职业教育公共实训中心等 。

江苏省南通中等专业学校与100多家企业、多所国内外院校和教育机构建立了友好合作关系，形成了以南通为中心、辐射长三角的学生就业网络。学生“双证率”达95.6%，就业、创业和升学率达98%以上。